Hoy publicaron un pequeño artículo en community Joomla acerca del uso de eclipse para desarrollos Joomla http://community.joomla.org/blogs/community/828-webinar-using-eclipse-for-joomla-development.html lo que realmente me extraña es que apenas hasta hoy presenten algo así.
Eclipse es una herramienta muy potente, no solo para desarrolladores Java, sino para quienes realizamos menesteres de otra indole, personalmente utilizo eclipse para el desarrollo de templates Joomla y WordPress que sumado a un buen conjunto de snippets me hacen la vida fácil 
es más, todas las templates realizadas a la fecha (cerca de unas 42) las he realizado usando eclipse y para esta tarea imprescindible el plugin aptana, aunque para la edición de proyectos php aptana aún no es suficiente, pero se cuenta con diversos proyectos (incluido el plugin zend).